Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SCP2P22307 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SCP2P22307 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCP2P22307 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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