Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRHP20396 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 MEF2C-AS1-205ENST00000509179 388 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 SOX2-OT-228ENST00000597828 864 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRHP20396 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 SPACA5-201ENST00000304355 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC079742.1-201ENST00000434951 357 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 SMCR2-201ENST00000456090 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 BMF-209ENST00000561282 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 C17orf98-201ENST00000614158 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 MIR6741-201ENST00000618782 63 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 Metazoa_SRP.168-201ENST00000621608 264 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 MECP2-213ENST00000622433 1071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC138907.9-201ENST00000623747 986 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRHP20396 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 CSTF3-203ENST00000438862 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 ACP1-207ENST00000439645 605 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 HTATIP2-203ENST00000443524 967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC008267.3-201ENST00000448776 712 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 RN7SL111P-201ENST00000468841 285 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 SMIM22-201ENST00000586005 366 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRHP20396 CA2-201ENST00000285379 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms