Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPD1P17405 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms