Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CARMN-205ENST00000518014 5131 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.9
VPREB1P12018 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CACNA1G-225ENST00000512389 6837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC007614.5-201ENST00000623424 8892 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
VPREB1P12018 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms