Protein–RNA interactions for Protein: O95447

LCA5L, Lebercilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5LO95447 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LCA5LO95447 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms