Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC009779.7-201ENST00000609031 469 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ABCC9O60706 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 CRYGD-201ENST00000264376 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 TAGLN2-201ENST00000320307 709 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC093072.1-201ENST00000589196 602 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 UBA52-213ENST00000599551 707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC9O60706 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 FANK1-203ENST00000368693 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 IGHV7-56-201ENST00000518372 351 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC026271.1-201ENST00000447794 1348 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC9O60706 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 PUF60-204ENST00000456095 1736 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 PIGL-202ENST00000395844 1257 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 ATP5G1P7-201ENST00000444398 400 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 RBMX-209ENST00000565438 1292 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 DEGS1-202ENST00000391877 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC9O60706 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 MIR6871-201ENST00000613433 56 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 CNBP-207ENST00000502976 1626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC9O60706 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 TPM3P7-201ENST00000338274 732 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 AC116036.2-201ENST00000607592 462 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC9O60706 AL133551.1-201ENST00000610279 1222 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms