Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CCDC169A6NNP5 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CCDC169A6NNP5 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms