Protein–RNA interactions for Protein: U3KQV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQV3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
U3KQV3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U3KQV3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U3KQV3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U3KQV3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U3KQV3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
U3KQV3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
U3KQV3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
U3KQV3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
U3KQV3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
U3KQV3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
U3KQV3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
U3KQV3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
U3KQV3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
U3KQV3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
U3KQV3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
U3KQV3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms