Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PIAS3Q9Y6X2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PIAS3Q9Y6X2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms