Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RPS6KL1Q9Y6S9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RPS6KL1Q9Y6S9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms