Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DNMT3AQ9Y6K1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DNMT3AQ9Y6K1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNMT3AQ9Y6K1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms