Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TTLL3Q9Y4R7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TTLL3Q9Y4R7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms