Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L5

RAP2C, Ras-related protein Rap-2c, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP2CQ9Y3L5 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAP2CQ9Y3L5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAP2CQ9Y3L5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms