Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B7

MRPL11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL11Q9Y3B7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MRPL11Q9Y3B7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MRPL11Q9Y3B7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MRPL11Q9Y3B7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms