Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMED5Q9Y3A6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMED5Q9Y3A6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms