Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM2AQ9Y2K7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM2AQ9Y2K7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM2AQ9Y2K7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms