Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPB41L3Q9Y2J2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPB41L3Q9Y2J2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms