Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHKBQ9Y259 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CHKBQ9Y259 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.1 ms