Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RCE1Q9Y256 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RCE1Q9Y256 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms