Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HIGD1AQ9Y241 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HIGD1AQ9Y241 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms