Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HPS5Q9UPZ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HPS5Q9UPZ3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HPS5Q9UPZ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms