Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SATB2Q9UPW6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SATB2Q9UPW6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms