Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM8

AP4E1, AP-4 complex subunit epsilon-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4E1Q9UPM8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP4E1Q9UPM8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP4E1Q9UPM8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms