Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FZD1Q9UP38 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FZD1Q9UP38 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FZD1Q9UP38 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms