Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX7Q9UNH6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX7Q9UNH6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX7Q9UNH6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms