Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
L1RE1Q9UN81 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
L1RE1Q9UN81 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
L1RE1Q9UN81 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms