Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYNRGQ9UMZ2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYNRGQ9UMZ2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNRGQ9UMZ2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNRGQ9UMZ2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYNRGQ9UMZ2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms