Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
TMCC3Q9ULS5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TMCC3Q9ULS5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms