Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL46

PSME2, Proteasome activator complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME2Q9UL46 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PSME2Q9UL46 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PSME2Q9UL46 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PSME2Q9UL46 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms