Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PNMA2Q9UL42 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PNMA2Q9UL42 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PNMA2Q9UL42 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms