Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZNF346Q9UL40 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZNF346Q9UL40 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms