Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ITGA11Q9UKX5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ITGA11Q9UKX5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ITGA11Q9UKX5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms