Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL6

PCTP, Phosphatidylcholine transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCTPQ9UKL6 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCTPQ9UKL6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCTPQ9UKL6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCTPQ9UKL6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms