Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDC23Q9UJX2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDC23Q9UJX2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDC23Q9UJX2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms