Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SALL4Q9UJQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SALL4Q9UJQ4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms