Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RIMS3Q9UJD0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms