Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDH22Q9UJ99 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDH22Q9UJ99 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH22Q9UJ99 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms