Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HERC5Q9UII4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
HERC5Q9UII4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HERC5Q9UII4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms