Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYTH4Q9UIA0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYTH4Q9UIA0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms