Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SFMBT1Q9UHJ3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SFMBT1Q9UHJ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFMBT1Q9UHJ3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms