Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ABCF2Q9UG63 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ABCF2Q9UG63 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ABCF2Q9UG63 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms