Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CNOT8Q9UFF9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNOT8Q9UFF9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNOT8Q9UFF9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms