Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
DBF4Q9UBU7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DBF4Q9UBU7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
DBF4Q9UBU7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms