Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLKQ9UBT6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
POLKQ9UBT6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLKQ9UBT6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLKQ9UBT6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms