Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DKK3Q9UBP4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DKK3Q9UBP4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms