Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM1

PEMT, Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEMTQ9UBM1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PEMTQ9UBM1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PEMTQ9UBM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms