Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRP2BPQ9P2M1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LRP2BPQ9P2M1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRP2BPQ9P2M1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms