Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.27
CC2D2AQ9P2K1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
CC2D2AQ9P2K1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CC2D2AQ9P2K1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CC2D2AQ9P2K1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms