Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
IGSF9Q9P2J2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGSF9Q9P2J2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF9Q9P2J2 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF9Q9P2J2 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF9Q9P2J2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF9Q9P2J2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF9Q9P2J2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
IGSF9Q9P2J2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms