Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VAPAQ9P0L0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VAPAQ9P0L0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VAPAQ9P0L0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms